Współpraca obu Izb jest niezwykle ścisła. W ostatnich latach odbywają się coroczne konsultacje organów kontroli Polski i Niemiec. Najważniejszym punktem tegorocznych konsultacji jest rozliczanie podatku VAT na rynku usług telekomunikacyjnych, nadawczych i elektronicznych. Obecnie kończy się kontrola handlu internetowego, w której uczestniczą Federalna Izba Obrachunkowa Niemiec, Najwyższy Urząd Kontroli Czech i Najwyższa Izba Kontroli. Jej celem jest porównanie działalności administracji podatkowej w tych trzech krajach w zakresie stosowania podatku VAT w handlu internetowym. Wspólną częścią kontroli jest sprawdzenie działalności systemu MOSS (Mini One-Stop-Shop), który obejmuje dystrybucję VAT za usługi telekomunikacyjne, nadawcze i elektroniczne. To stosunkowo młody mechanizm, funkcjonuje w Unii Europejskiej od trzech lat. Dotyczy usług świadczonych przez płatników VAT (firmy) na rzecz konsumentów, zlokalizowanych w innym państwie członkowskim. Główną zasadą jest uwzględnienie konsumpcyjnego charakteru tego podatku i zapewnienie, że przychody z VAT będą zasilały budżet państwa, w którym usługi są konsumowane a nie wytwarzane. Przed administracją podatkową stoi potężne wyzwanie. Od 2021 r. system MOSS ma objąć sprzedaż towarów a nie tylko usług elektronicznych. Spowoduje to lawinowy wzrost liczby transakcji objętych tym systemem, a co za tym idzie może wzrosnąć ryzyko wystąpienia nadużyć. W związku z rozszerzeniem zakresu systemu MOSS w Ministerstwie Finansów powołany został w marcu specjalny zespół, który ma zająć się analizą ściągalności VAT-u z transakcji internetowych. Raport w tej sprawie ma być gotowy do końca roku.

W Polsce zadania MOSS realizują dwa urzędy.  Drugi Urząd Skarbowy Warszawa - Śródmieście przyjmuje VAT od przedsiębiorców działających w Polsce i przekazuje go do państw, w których mieszkają kupujący usługę elektroniczną. Łódzki Urząd Skarbowy przyjmuje wpłaty podatku VAT przekazywane przez system MOSS z innych państw. W latach 2015 - 2017 po odliczeniu kwot przysługujących państwu, w którym podatnik jest zarejestrowany, Polska przekazała poszczególnym państwom Unii w sumie ponad 6 mln 700 tys. euro. Najwięcej do Niemiec i Wielkiej Brytanii. Z kolei Polska za pośrednictwem MOSS otrzymała ponad 108 mln euro, najwięcej z Irlandii i Wielkiej Brytanii.